tracrRNA

Die tracrRNA (trans-activating crRNA) ist eine kurze RNA, die mit ihrem einen Ende (5′ Ende) über Basenpaarung  an die Repeat Sequenzen von crRNAs bindet. Erinnern wir uns: die crRNA besteht aus einem Stück, das spezifisch auf eine Virus-DNA passt und einem Stück „Repeat“, das bei allen crRNAs gleich ist. Das andere Ende der tracrRNA weist ein starke Faltung (Sekundärstruktur) auf und ist notwendig, damit der Komplex aus crRNA und tracrRNA an das  Schneideenzym (Cas9) binden kann. Für eine einfachere Anwendung können tracrRNA und crRNA künstlich zu einer „single guide“ oder sgRNA verbunden werden (s. auch Abbildung bei sgRNA)