Grundlagen The World of CRISPR with Khalid! – CRISPR-Cas Base Editing 2 Aug 2021 "Mit CRISPR-Cas gezielt einzelne Basen austauschen, ohne dabei einen Doppelstrangbruch zu verursachen?" Ja, das funktioniert! Vor 5 Jahren berichtete ein Forscherteam um Dr. David Liu an der Harvard University erstmals…
Grundlagen The World of CRISPR with Khalid! – dCas9 als epigenetischer Modifikator 9 Jun 2021 Die "Epigenetik" ist der Forschungszweig, der Modifikationen von Genfunktionen untersucht, die nicht durch direkte Veränderung der DNA-Sequenz verursacht werden. So können beispielsweise durch Methylierung der DNA bestimmte Genbereiche einfach abgeschaltet…
Grundlagen CRISPR-Cas-Systeme 19 Mai 2021 Warum einfach, wenn’s auch kompliziert geht?Es gibt viele verschiedene, sehr unterschiedliche CRISPR-Cas-Systeme Die verschiedenen CRISPR-Cas-Systeme sind in der Evolution vermutlich mehrfach entstanden. Das heißt, obwohl das Konzept gleich ist, hat…
Grundlagen The World of CRISPR with Khalid! – nCas9 und dCas9 30 Mär 20216 Apr 2021 In einem neuen Stop-Motion-Video aus der Reihe „The World of CRISPR with Khalid!“ widmet sich Khalid diesmal zwei besonders modifizierten Cas9-Proteinen, der Nickase "nCas9" und dem "toten" dCas9, das "d"…
Grundlagen CRISPR-Cas 18 Feb 202112 Mär 2021 Der Ausdruck „CRISPR-Cas“ beschreibt eine Abwehrstrategie von Bakterien gegen Viren. Das Bakterium „merkt“ sich bestimmte Abfolgen viraler DNA und zerschneidet diese bei einem erneuten Auftreten mit Hilfe eines Cas-Enzyms. „CRISPR“…
Grundlagen The World of CRISPR with Khalid! – PAM 12 Jan 202118 Jan 2021 In seinem jüngsten Stop-Motion-Video aus der Reihe „The World of CRISPR with Khalid!“ erklärt Khalid sehr anschaulich, was es mit den PAM-Sequenzen auf sich hat. Zusätzliche Informationen finden sich in…
Grundlagen „The World of CRISPR with Khalid!“ 30 Nov 202011 Jan 2021 Mit Muhammad Khalid Abdullah haben wir einen neuen Künstler für CRISPR-Whisper gewonnen, der in lockerer Folge Stop-Motion-Videos zur Erklärung verschiedener CRISPR-Methoden machen wird.Khalid studiert Biologie im Masterstudiengang an der University…
Grundlagen Nature of Science, oder was verstehen Fliegen von Schwerkraft? 26 Mai 20202 Jun 2020 Fliegen in einer Flasche... Was hat das mit wissenschaftlicher Erkenntnis zu tun? Ist etwas an der Aussage dran, dass kein Ergebnis auch ein Ergebnis ist? Wann ist ein Experiment aussagekräftig?…
Grundlagen Wie entsteht eine wissenschaftliche Publikation? 27 Apr 202027 Apr 2020 In einer Reihe von Beiträgen möchten wir die aktuelle Forschung der Arbeitsgruppen im CRISPR-Konsortium (SPP 2141) näher und einigermaßen verständlich beschreiben. Dazu benutzen wir die offiziellen Projektbeschreibungen der DFG (Deutsche…
Grundlagen CRISPR-Cas Mysterien – Teil 3: Das Familienalbum 23 Okt 201928 Okt 2019 Die Entdeckung des CRISPR-Cas9-System war nur der Anfang: Ständig kommen neue Systeme hinzu und werden weitere Cas-Proteine entdeckt. Wir haben in einer Art Familienalbum einmal die bislang prominentesten Vertreter zusammengestellt und…
Grundlagen Das „Cracking-Gel“-Experiment 18 Sept 201927 Jul 2020 Beim Laborkurs im Gläsernen Labor in Berlin-Buch ergänzte das CRISPR-Whisper-Team sein Experiment um eine weitere Variante: Um zu prüfen, ob die Transformation der Bakterien via CRISPR-Cas geklappt hat, kann das…
Grundlagen CRISPR-Cas Mysterien – Teil 2 14 Aug 201912 Okt 2020 CRISPR-Cas ist ein Immunsystem für Bakterien und Archaea. Forscher haben aber auch CRISPR-Cas-Systeme entdeckt, die andere oder auch auf den ersten Blick keine Funktionen haben. – Wir erklären die wichtigsten…
Grundlagen Was machen Waisenkinder? 14 Aug 201912 Okt 2020 Cas-Proteine ohne CRISPR-Arrays und CRISPR-Arrays ohne Cas-Proteine erscheinen so nutzlos, wie Beamte ohne Formulare oder Formulare ohne Beamte. Im Gegensatz zu manchen Behörden, würden in einem biologischen Organismus Beamte (=…
Grundlagen CRISPR-Cas Mysterien – Teil 1 11 Jul 201912 Okt 2020 CRISPR-Cas ist ein Immunsystem für Bakterien und Archaea. Forscher haben aber auch CRISPR-Cas-Systeme entdeckt, die andere oder auch auf den ersten Blick keine Funktionen haben. – Wir erklären die wichtigsten…
Grundlagen Die Waisenkinder 11 Jul 201912 Okt 2020 Von vielen Proteinen kennt man Funktionen, die sie nur mit einem Partner gemeinsam ausführen können. So ist für die Genom-Editierung ein Cas-Protein (z.B. Cas9) auf eine CRISPR-RNA (crRNA) angewiesen, um…
Grundlagen Was ist eigentlich Grundlagenforschung und braucht man die wirklich? 26 Jun 201912 Okt 2020 Wenn Wissenschaftler den "Normalbürgern" erklären, woran sie arbeiten, gibt es oft nur verständnisloses Schulterzucken. Das liegt einerseits daran, dass Wissenschaftler ihre Wissenschaft studiert haben und eben nicht Wissenschaftskommunikation. Zum anderen…
Grundlagen Labor-Impressionen 22 Feb 20197 Apr 2020 Im Gentechnik-Labor wird nicht mit Spritzen und bunten Flüssigkeiten gearbeitet, sondern im wesentlichen mit Präzisionspipetten. Ludger Weß hat an unserem ersten CRISPR-Whisper-Laborkurs teilgenommen und uns seine Aufnahmen zur Verfügung gestellt.
Grundlagen Die CRISPR-Story – Teil 3/3 19 Dez 2018 Die Grundlagen zu CRISPR-Cas – erklärt in einem Comic! Die Helden unserer Geschichte werden hier noch einmal extra vorgestellt. Heute erfahren wir, wie Bio-Hacker Leopold Walters Trickkiste für seine Zwecke nutzt. Wer…
Grundlagen Elektrophorese 13 Dez 201827 Jul 2020 Das DNA-Molekül ist ein dünner Faden – ein sehr dünner Faden mit einem Durchmesser von rund 2 Nanometern (1 nm = 10-9 m) und selbst mit einem guten, normalen Lichtmikroskop…
Grundlagen Wie funktioniert eine PCR-Maschine? 11 Dez 20189 Feb 2021 Die Polymerasekettenreaktion ("Polymerase Chain Reaction" = "PCR") ist eine geniale Erfindung. Jüngere Wissenschaftler können sich gar nicht mehr vorstellen, wie Molekularbiologie ohne PCR überhaupt möglich war! Das Konzept orientiert sich…
Grundlagen CRISPR-Cas-Crash-Kurs, Teil 3 oder „Die PCR-Maschine“ 6 Dez 20187 Apr 2020 Wie würde ein Laie – sagen wir ein Comic-Zeichner – die Funktionsweise einer PCR-Maschine erklären? So: Ein überaus wichtiges Werkzeug der Molekularbiologie ist die PCR. Sie kommt u.a. beim Ermitteln…