Laborleben Das war „Pauline und die Ausreißer“ 21 Apr 2021 Das Geheimnis der blauen Ausreißer ist gelüftet und unser kleines CRISPR-Forschungsprojekt zum Mitmachen, das wir euch in den vergangenen Monaten vorgestellt haben, ist abgeschlossen. Wir möchten in diesem Beitrag aber…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 8) – Des Rätsels Lösung! 10 Mär 2021 Weiter geht’s mit dem Sequenzieren. Nach dem nun klar war, dass die Zielsequenz auf dem lacZ-Gen nicht mutiert ist, hat sich Pauline der crRNA-Sequenz gewidmet. Zunächst hat sie dafür wieder…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 7) – Die Zielsequenz sequenzieren 9 Feb 202110 Feb 2021 Liegt das Geheimnis der CRISPR-Escaper in einer (winzigen) Abweichung ihres genetischen Codes versteckt? Haben die blauen Ausreißer womöglich eine stumme Mutation in der CRISPR-Cas-Zielsequenz auf dem lacZ-Gen, so dass sie…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 6) – Colony PCR 5 Jan 2021 Vor der Weihnachtspause hat Pauline bereits durch ihr Cracking-Gel festgestellt, dass die blauen Ausreißer tatsächlich beide Plasmide enthalten. Somit sehen sie äußerlich und auch auf dem Agarose-Gel so aus wie…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 5) – Ein Blick auf die Plasmide 3 Dez 2020 Kann es sein, dass die blauen Ausreißer das Plasmid „pCas9“ gar nicht haben? Dann wäre das lacZ-Gen intakt. Pauline hat die blauen Zellen auf einer Platte mit Ampicillin und Chloramphenicol…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 4) – Wie hoch ist der Anteil an Ausreißern? 25 Nov 202026 Nov 2020 Die blauen Ausreißer-Kolonien in den geCRISPRten Bakterien sind selten. Vielleicht haben wir einen Fehler gemacht, und es sind uns ein paar wenige blaue Zellen „einfach ins Experiment gefallen“? Wir müssen…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 3) – Die Suche nach blauen Kolonien 17 Nov 2020 Pauline hat sich zunächst die Aufgabe gestellt, mehr von den Ausreißern zu finden. Wie reproduzierbar sind sie, d.h. gibt es sie in jedem Experiment und wenn ja, wie viele davon?…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 2) – Das CRISPR-Experiment kurz erklärt 13 Nov 202013 Nov 2020 Einige Bakterien, wie z. B. das Darmbakterium Escherichia coli, können das Protein Lactase (auch β-Galactosidase genannt) herstellen. Dabei handelt es sich um ein Enzym, das den Milchzucker Lactose (ein „Doppelzucker“…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 1) – Ein kleines Forschungsprojekt zum Mitmachen 3 Nov 202013 Nov 2020 Science Bridge hat ein einfaches Experiment zu CRISPR-Cas entwickelt, die Publikation dazu gibt es unter https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1046202319300039. Ganz kurz zusammengefasst:In einem E. coli-Bakterienstamm liegt das Plasmid pSB20 HIII mit dem lacZ-Gen…
CRISPR whisper 