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CRISPR whisper

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News aus dem DFG-Projekt zu CRISPR-Cas

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Schlagwort: CRISPR-Cas

Forschen

Aktuelle Publikation: Wie arbeiten CRISPR-Cas Proteine eigentlich in der Zelle?

7 Apr 2021
Hier geht es darum, eine Methode für die Forschung zu entwickeln, mit der Proteine innerhalb einer Zelle mit sehr hoher Auflösung betrachtet und bei ihrer Arbeit verfolgt werden können. Mit…
Grundlagen

The World of CRISPR with Khalid! – nCas9 und dCas9

30 Mrz 20216 Apr 2021
In einem neuen Stop-Motion-Video aus der Reihe „The World of CRISPR with Khalid!“ widmet sich Khalid diesmal zwei besonders modifizierten Cas9-Proteinen, der Nickase "nCas9" und dem "toten" dCas9, das "d"…
Forschen

Online-Meeting des SPP2141

24 Mrz 202124 Mrz 2021
Jährlich treffen sich die Forscherinnen und Forscher des DFG-Schwerpunkprogramms „CRISPR-Cas – beyond defence“ zum wissenschaftlichen Austausch. Pandemiebedingt in diesem Jahr nicht wie geplant in Bonn, sondern per Video-Schalte im Online-Meeting.…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 8) – Des Rätsels Lösung!

10 Mrz 2021
Weiter geht’s mit dem Sequenzieren. Nach dem nun klar war, dass die Zielsequenz auf dem lacZ-Gen nicht mutiert ist, hat sich Pauline der crRNA-Sequenz gewidmet. Zunächst hat sie dafür wieder…
Grundlagen

CRISPR-Cas

18 Feb 202112 Mrz 2021
Der Ausdruck „CRISPR-Cas“ beschreibt eine Abwehrstrategie von Bakterien gegen Viren. Das Bakterium „merkt“ sich bestimmte Abfolgen viraler DNA und zerschneidet diese bei einem erneuten Auftreten mit Hilfe eines Cas-Enzyms. „CRISPR“…
Forschen

Wir haben nachgefragt

15 Feb 2021
Diesmal bei Marie-Kristin von Wrisberg, frisch gebackene Doktorin der Naturwissenschaften und seit September 2020 zunächst für 2 Jahre wissenschaftliche Mitarbeiterin in der Gruppe von Sabine Schneider, eine der Forscherinnen aus…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 7) – Die Zielsequenz sequenzieren

9 Feb 202110 Feb 2021
Liegt das Geheimnis der CRISPR-Escaper in einer (winzigen) Abweichung ihres genetischen Codes versteckt? Haben die blauen Ausreißer womöglich eine stumme Mutation in der CRISPR-Cas-Zielsequenz auf dem lacZ-Gen, so dass sie…
Forschen

Wir haben nachgefragt

1 Feb 202115 Feb 2021
Zahlreiche Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler gehen im Rahmen des DFG-Schwerpunktprogramms (SPP 2141) den vielen verschiedenen Funktionen der Genschere CRISPR-Cas auf den Grund. Einer von ihnen ist Dr. Uri Gophna, Professor an…
Grundlagen

The World of CRISPR with Khalid! – PAM

12 Jan 202118 Jan 2021
In seinem jüngsten Stop-Motion-Video aus der Reihe „The World of CRISPR with Khalid!“ erklärt Khalid sehr anschaulich, was es mit den PAM-Sequenzen auf sich hat. Zusätzliche Informationen finden sich in…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 6) – Colony PCR

5 Jan 2021
Vor der Weihnachtspause hat Pauline bereits durch ihr Cracking-Gel festgestellt, dass die blauen Ausreißer tatsächlich beide Plasmide enthalten. Somit sehen sie äußerlich und auch auf dem Agarose-Gel so aus wie…
News

Preisverleihung IGN-Studierendenwettbewerb

15 Dez 2020
Vor 12 Jahren hat Science Bridge begonnen, das „Indonesian-German-Network Biology“ (IGN) aufzubauen. Inzwischen beteiligen sich etwa 20 Universitäten aus ganz Indonesien und Wissenschaffende aus verschiedenen Universitäten und Forschungsinstituten in Deutschland…
News

Verleihung des Chemie-Nobelpreises 2020 an Emmanuelle Charpentier und Jennifer A. Doudna

10 Dez 202010 Dez 2020
Am 07. Oktober war es endlich soweit - die Trägerinnen des diesjährigen Chemie-Nobelpreises wurden bekannt gegeben. Und es kam so, wie viele es vermutet hatten. Emmanuelle Charpentier und Jennifer Doudna,…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 5) – Ein Blick auf die Plasmide

3 Dez 2020
Kann es sein, dass die blauen Ausreißer das Plasmid „pCas9“ gar nicht haben? Dann wäre das lacZ-Gen intakt. Pauline hat die blauen Zellen auf einer Platte mit Ampicillin und Chloramphenicol…
Grundlagen

„The World of CRISPR with Khalid!“

30 Nov 202011 Jan 2021
Mit Muhammad Khalid Abdullah haben wir einen neuen Künstler für CRISPR-Whisper gewonnen, der in lockerer Folge Stop-Motion-Videos zur Erklärung verschiedener CRISPR-Methoden machen wird.Khalid studiert Biologie im Masterstudiengang an der University…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 4) – Wie hoch ist der Anteil an Ausreißern?

25 Nov 202026 Nov 2020
Die blauen Ausreißer-Kolonien in den geCRISPRten Bakterien sind selten. Vielleicht haben wir einen Fehler gemacht, und es sind uns ein paar wenige blaue Zellen „einfach ins Experiment gefallen“? Wir müssen…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 3) – Die Suche nach blauen Kolonien

17 Nov 2020
Pauline hat sich zunächst die Aufgabe gestellt, mehr von den Ausreißern zu finden. Wie reproduzierbar sind sie, d.h. gibt es sie in jedem Experiment und wenn ja, wie viele davon?…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 2) – Das CRISPR-Experiment kurz erklärt

13 Nov 202013 Nov 2020
Einige Bakterien, wie z. B. das Darmbakterium Escherichia coli, können das Protein Lactase (auch β-Galactosidase genannt) herstellen. Dabei handelt es sich um ein Enzym, das den Milchzucker Lactose (ein „Doppelzucker“…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 1) – Ein kleines Forschungsprojekt zum Mitmachen

3 Nov 202013 Nov 2020
Science Bridge hat ein einfaches Experiment zu CRISPR-Cas entwickelt, die Publikation dazu gibt es unter https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1046202319300039. Ganz kurz zusammengefasst:In einem E. coli-Bakterienstamm liegt das Plasmid pSB20 HIII mit dem lacZ-Gen…
Forschen

Evolution von CRISPR-Systemen in prokaryotischen Populationen

12 Okt 2020
Leitung: Franz Baumdicker Mitarbeitende: Klara Burger, offene Stellen zu vergeben (siehe letzter Abschnitt) Standort: Universität Tübingen Kurzbeschreibung des Projekts: Franz Baumdicker beschäftigt sich mit mathematischen Modellen, mit denen die Evolution…
Forschen

Diversität verschiedener CRISPR-Cas-Systeme am Beispiel des Cyanobakteriums Synechocystis

29 Sep 2020
Leitung: Wolfgang R. Hess Mitarbeiter: Raphael Bilger Standort: Cyanolab, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg Kurzbeschreibung des Projekts: Cyanobakterien gehören zu den ältesten nachweisbaren Lebensformen der Erde. Die Entwicklung der Sauerstoff-freisetzenden Photosynthese in dieser…
Forschen

Können tiefe neuronale Netzwerke die CRISPR-Cas „Grammatik“ entschlüsseln?

14 Sep 202014 Sep 2020
Leitung: Alice C. McHardy Mitarbeiter: Philipp C. Münch und René Mreches Standort: Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung GmbH, Braunschweig Kurzbeschreibung des Projekts: Die Arbeitsgruppe “Bioinformatik der Infektionsforschung” um Alice C. McHardy erforscht…

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Ältere Beiträge

Willkommen!

Willkommen bei CRISPR-Whisper! Hier berichten Wissenschaftler aus dem DFG-geförderten Schwerpunktprogramm 2141 „Weitaus mehr als nur Verteidigung: die vielen verschiedenen Funktionen des CRISPR-Cas Systems“ über ihre Arbeit. Es geht darum herauszufinden, welche Funktionen die „Gen-Schere“ CRISPR-Cas über die Virenabwehr hinaus noch hat. Fragen und Kommentare sind willkommen!

Aktuelle Beiträge

  • Aktuelle Publikation: Wie arbeiten CRISPR-Cas Proteine eigentlich in der Zelle?
  • The World of CRISPR with Khalid! – nCas9 und dCas9
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Bildnachweis: Hintze/Universität Ulm
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