Grundlagen The World of CRISPR with Khalid! – PAM 12 Jan 2021 In seinem jüngsten Stop-Motion-Video aus der Reihe „The World of CRISPR with Khalid!“ erklärt Khalid sehr anschaulich, was es mit den PAM-Sequenzen auf sich hat. Zusätzliche Informationen finden sich in…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 6) – Colony PCR 5 Jan 2021 Vor der Weihnachtspause hat Pauline bereits durch ihr Cracking-Gel festgestellt, dass die blauen Ausreißer tatsächlich beide Plasmide enthalten. Somit sehen sie äußerlich und auch auf dem Agarose-Gel so aus wie…
News Preisverleihung IGN-Studierendenwettbewerb 15 Dez 2020 Vor 12 Jahren hat Science Bridge begonnen, das „Indonesian-German-Network Biology“ (IGN) aufzubauen. Inzwischen beteiligen sich etwa 20 Universitäten aus ganz Indonesien und Wissenschaffende aus verschiedenen Universitäten und Forschungsinstituten in Deutschland…
News Verleihung des Chemie-Nobelpreises 2020 an Emmanuelle Charpentier und Jennifer A. Doudna 10 Dez 202010 Dez 2020 Am 07. Oktober war es endlich soweit - die Trägerinnen des diesjährigen Chemie-Nobelpreises wurden bekannt gegeben. Und es kam so, wie viele es vermutet hatten. Emmanuelle Charpentier und Jennifer Doudna,…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 5) – Ein Blick auf die Plasmide 3 Dez 2020 Kann es sein, dass die blauen Ausreißer das Plasmid „pCas9“ gar nicht haben? Dann wäre das lacZ-Gen intakt. Pauline hat die blauen Zellen auf einer Platte mit Ampicillin und Chloramphenicol…
Grundlagen „The World of CRISPR with Khalid!“ 30 Nov 202011 Jan 2021 Mit Muhammad Khalid Abdullah haben wir einen neuen Künstler für CRISPR-Whisper gewonnen, der in lockerer Folge Stop-Motion-Videos zur Erklärung verschiedener CRISPR-Methoden machen wird.Khalid studiert Biologie im Masterstudiengang an der University…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 4) – Wie hoch ist der Anteil an Ausreißern? 25 Nov 202026 Nov 2020 Die blauen Ausreißer-Kolonien in den geCRISPRten Bakterien sind selten. Vielleicht haben wir einen Fehler gemacht, und es sind uns ein paar wenige blaue Zellen „einfach ins Experiment gefallen“? Wir müssen…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 3) – Die Suche nach blauen Kolonien 17 Nov 2020 Pauline hat sich zunächst die Aufgabe gestellt, mehr von den Ausreißern zu finden. Wie reproduzierbar sind sie, d.h. gibt es sie in jedem Experiment und wenn ja, wie viele davon?…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 2) – Das CRISPR-Experiment kurz erklärt 13 Nov 202013 Nov 2020 Einige Bakterien, wie z. B. das Darmbakterium Escherichia coli, können das Protein Lactase (auch β-Galactosidase genannt) herstellen. Dabei handelt es sich um ein Enzym, das den Milchzucker Lactose (ein „Doppelzucker“…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 1) – Ein kleines Forschungsprojekt zum Mitmachen 3 Nov 202013 Nov 2020 Science Bridge hat ein einfaches Experiment zu CRISPR-Cas entwickelt, die Publikation dazu gibt es unter https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1046202319300039. Ganz kurz zusammengefasst:In einem E. coli-Bakterienstamm liegt das Plasmid pSB20 HIII mit dem lacZ-Gen…
Forschen Evolution von CRISPR-Systemen in prokaryotischen Populationen 12 Okt 2020 Leitung: Franz Baumdicker Mitarbeitende: Klara Burger, offene Stellen zu vergeben (siehe letzter Abschnitt) Standort: Universität Tübingen Kurzbeschreibung des Projekts: Franz Baumdicker beschäftigt sich mit mathematischen Modellen, mit denen die Evolution…
Forschen Diversität verschiedener CRISPR-Cas-Systeme am Beispiel des Cyanobakteriums Synechocystis 29 Sep 2020 Leitung: Wolfgang R. Hess Mitarbeiter: Raphael Bilger Standort: Cyanolab, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg Kurzbeschreibung des Projekts: Cyanobakterien gehören zu den ältesten nachweisbaren Lebensformen der Erde. Die Entwicklung der Sauerstoff-freisetzenden Photosynthese in dieser…
Forschen Können tiefe neuronale Netzwerke die CRISPR-Cas „Grammatik“ entschlüsseln? 14 Sep 202014 Sep 2020 Leitung: Alice C. McHardy Mitarbeiter: Philipp C. Münch und René Mreches Standort: Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung GmbH, Braunschweig Kurzbeschreibung des Projekts: Die Arbeitsgruppe “Bioinformatik der Infektionsforschung” um Alice C. McHardy erforscht…
Forschen Gestresste Bakterien 13 Jul 2020 Leitung: Gabriele Klug Mitarbeitende: Timon Spanka, Jonas Kretz Standort: Institut für Mikro- und Molekularbiologie, Universität Gießen Beim Menschen wird physische, vor allem aber psychische Belastung als Stress bezeichnet. Was aber stresst…
Forschen FRET – Mit Fluoreszenz den ungewöhnlichen Funktionen von Cas9 auf der Spur 16 Jun 202027 Jul 2020 Leitung: Dina Grohmann Mitarbeitende: Elisabeth Wörle (Doktorandin), Andreas Schmidbauer (Master-Student), Dr. Leonhard Jakob (PostDoc) Standort: Institut für Biochemie, Genetik und Mikrobiologie, Regensburg Kurzbeschreibung des Projekts: Das Labor von Dina Grohmann…
Forschen Aktuelle Publikation: Wie das zahnlose Cas(cade) die Proteinbiosynthese stört 3 Jun 202027 Jul 2020 Anfang Mai haben wir die erste Arbeitsgruppe aus dem DFG-Schwerpunktprogramm um Anita Marchfelder und deren Forschung am Haloarchaeon Haloferax volcanii vorgestellt. Die jüngsten Erkenntnisse aus diesem CRISPR-Cas Projekt wurden vom…
Grundlagen Nature of Science, oder was verstehen Fliegen von Schwerkraft? 26 Mai 20202 Jun 2020 Fliegen in einer Flasche... Was hat das mit wissenschaftlicher Erkenntnis zu tun? Ist etwas an der Aussage dran, dass kein Ergebnis auch ein Ergebnis ist? Wann ist ein Experiment aussagekräftig?…
Forschen Funktionelle Analyse von Shewanella putrefaciens Typ I-Fv und Aromatoleum aromaticum Typ IV CRISPR-Cas Ribonukleoproteinkomplexen 22 Mai 202027 Jul 2020 Leitung: Lennart Randau Mitarbeiter: NN Standort: Philipps-Universität Marburg Kurzbeschreibung des Projekts: Die Arbeitsgruppe von Lennart Randau untersucht (unter anderem) ein sehr seltsames CRISPR-Cas System, den sogenannten Typ IV, den es…
Forschen CRISPR-Cas Forschung – Beyond Defence 12 Mai 202026 Mai 2020 Vor mehr als zehn Jahren wurde das Immunsystem von Bakterien und Archaeen entdeckt: CRISPR-Cas. Seit seiner Entdeckung wurde das System eingehend untersucht und es wurden viele neue Erkenntnissen gewonnen, wie…
Forschen CRISPR-Cas Systeme in Haloarchaea: Zusätzliche Funktionen, die nicht zur Verteidigung dienen 7 Mai 202027 Jul 2020 Leitung: Anita Marchfelder Mitarbeiter: Pascal Märkle Standort: Universität Ulm Kurzbeschreibung des Projekts: Vor mehr als zehn Jahren wurde das Immunsystem von Bakterien und Archaeen entdeckt: CRISPR-Cas. Seit seiner Entdeckung wurde…
Grundlagen Wie entsteht eine wissenschaftliche Publikation? 27 Apr 202027 Apr 2020 In einer Reihe von Beiträgen möchten wir die aktuelle Forschung der Arbeitsgruppen im CRISPR-Konsortium (SPP 2141) näher und einigermaßen verständlich beschreiben. Dazu benutzen wir die offiziellen Projektbeschreibungen der DFG (Deutsche…
