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CRISPR whisper

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News aus dem DFG-Projekt zu CRISPR-Cas

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Schlagwort: CRISPR-Cas

Grundlagen

The World of CRISPR with Khalid! – PAM

12 Jan 2021
In seinem jüngsten Stop-Motion-Video aus der Reihe „The World of CRISPR with Khalid!“ erklärt Khalid sehr anschaulich, was es mit den PAM-Sequenzen auf sich hat. Zusätzliche Informationen finden sich in…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 6) – Colony PCR

5 Jan 2021
Vor der Weihnachtspause hat Pauline bereits durch ihr Cracking-Gel festgestellt, dass die blauen Ausreißer tatsächlich beide Plasmide enthalten. Somit sehen sie äußerlich und auch auf dem Agarose-Gel so aus wie…
News

Preisverleihung IGN-Studierendenwettbewerb

15 Dez 2020
Vor 12 Jahren hat Science Bridge begonnen, das „Indonesian-German-Network Biology“ (IGN) aufzubauen. Inzwischen beteiligen sich etwa 20 Universitäten aus ganz Indonesien und Wissenschaffende aus verschiedenen Universitäten und Forschungsinstituten in Deutschland…
News

Verleihung des Chemie-Nobelpreises 2020 an Emmanuelle Charpentier und Jennifer A. Doudna

10 Dez 202010 Dez 2020
Am 07. Oktober war es endlich soweit - die Trägerinnen des diesjährigen Chemie-Nobelpreises wurden bekannt gegeben. Und es kam so, wie viele es vermutet hatten. Emmanuelle Charpentier und Jennifer Doudna,…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 5) – Ein Blick auf die Plasmide

3 Dez 2020
Kann es sein, dass die blauen Ausreißer das Plasmid „pCas9“ gar nicht haben? Dann wäre das lacZ-Gen intakt. Pauline hat die blauen Zellen auf einer Platte mit Ampicillin und Chloramphenicol…
Grundlagen

„The World of CRISPR with Khalid!“

30 Nov 202011 Jan 2021
Mit Muhammad Khalid Abdullah haben wir einen neuen Künstler für CRISPR-Whisper gewonnen, der in lockerer Folge Stop-Motion-Videos zur Erklärung verschiedener CRISPR-Methoden machen wird.Khalid studiert Biologie im Masterstudiengang an der University…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 4) – Wie hoch ist der Anteil an Ausreißern?

25 Nov 202026 Nov 2020
Die blauen Ausreißer-Kolonien in den geCRISPRten Bakterien sind selten. Vielleicht haben wir einen Fehler gemacht, und es sind uns ein paar wenige blaue Zellen „einfach ins Experiment gefallen“? Wir müssen…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 3) – Die Suche nach blauen Kolonien

17 Nov 2020
Pauline hat sich zunächst die Aufgabe gestellt, mehr von den Ausreißern zu finden. Wie reproduzierbar sind sie, d.h. gibt es sie in jedem Experiment und wenn ja, wie viele davon?…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 2) – Das CRISPR-Experiment kurz erklärt

13 Nov 202013 Nov 2020
Einige Bakterien, wie z. B. das Darmbakterium Escherichia coli, können das Protein Lactase (auch β-Galactosidase genannt) herstellen. Dabei handelt es sich um ein Enzym, das den Milchzucker Lactose (ein „Doppelzucker“…
Laborleben

Pauline und die Ausreißer (Teil 1) – Ein kleines Forschungsprojekt zum Mitmachen

3 Nov 202013 Nov 2020
Science Bridge hat ein einfaches Experiment zu CRISPR-Cas entwickelt, die Publikation dazu gibt es unter https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1046202319300039. Ganz kurz zusammengefasst:In einem E. coli-Bakterienstamm liegt das Plasmid pSB20 HIII mit dem lacZ-Gen…
Forschen

Evolution von CRISPR-Systemen in prokaryotischen Populationen

12 Okt 2020
Leitung: Franz Baumdicker Mitarbeitende: Klara Burger, offene Stellen zu vergeben (siehe letzter Abschnitt) Standort: Universität Tübingen Kurzbeschreibung des Projekts: Franz Baumdicker beschäftigt sich mit mathematischen Modellen, mit denen die Evolution…
Forschen

Diversität verschiedener CRISPR-Cas-Systeme am Beispiel des Cyanobakteriums Synechocystis

29 Sep 2020
Leitung: Wolfgang R. Hess Mitarbeiter: Raphael Bilger Standort: Cyanolab, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg Kurzbeschreibung des Projekts: Cyanobakterien gehören zu den ältesten nachweisbaren Lebensformen der Erde. Die Entwicklung der Sauerstoff-freisetzenden Photosynthese in dieser…
Forschen

Können tiefe neuronale Netzwerke die CRISPR-Cas „Grammatik“ entschlüsseln?

14 Sep 202014 Sep 2020
Leitung: Alice C. McHardy Mitarbeiter: Philipp C. Münch und René Mreches Standort: Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung GmbH, Braunschweig Kurzbeschreibung des Projekts: Die Arbeitsgruppe “Bioinformatik der Infektionsforschung” um Alice C. McHardy erforscht…
Forschen

Gestresste Bakterien

13 Jul 2020
Leitung: Gabriele Klug Mitarbeitende: Timon Spanka, Jonas Kretz Standort: Institut für Mikro- und Molekularbiologie, Universität Gießen Beim Menschen wird physische, vor allem aber psychische Belastung als Stress bezeichnet. Was aber stresst…
Forschen

FRET – Mit Fluoreszenz den ungewöhnlichen Funktionen von Cas9 auf der Spur

16 Jun 202027 Jul 2020
Leitung: Dina Grohmann Mitarbeitende: Elisabeth Wörle (Doktorandin), Andreas Schmidbauer (Master-Student), Dr. Leonhard Jakob (PostDoc) Standort: Institut für Biochemie, Genetik und Mikrobiologie, Regensburg Kurzbeschreibung des Projekts: Das Labor von Dina Grohmann…
Forschen

Aktuelle Publikation: Wie das zahnlose Cas(cade) die Proteinbiosynthese stört

3 Jun 202027 Jul 2020
Anfang Mai haben wir die erste Arbeitsgruppe aus dem DFG-Schwerpunktprogramm um Anita Marchfelder und deren Forschung am Haloarchaeon Haloferax volcanii vorgestellt. Die jüngsten Erkenntnisse aus diesem CRISPR-Cas Projekt wurden vom…
Grundlagen

Nature of Science, oder was verstehen Fliegen von Schwerkraft?

26 Mai 20202 Jun 2020
Fliegen in einer Flasche... Was hat das mit wissenschaftlicher Erkenntnis zu tun? Ist etwas an der Aussage dran, dass kein Ergebnis auch ein Ergebnis ist? Wann ist ein Experiment aussagekräftig?…
Forschen

Funktionelle Analyse von Shewanella putrefaciens Typ I-Fv und Aromatoleum aromaticum Typ IV CRISPR-Cas Ribonukleoproteinkomplexen

22 Mai 202027 Jul 2020
Leitung: Lennart Randau Mitarbeiter: NN Standort: Philipps-Universität Marburg Kurzbeschreibung des Projekts: Die Arbeitsgruppe von Lennart Randau untersucht (unter anderem) ein sehr seltsames CRISPR-Cas System, den sogenannten Typ IV, den es…
Forschen

CRISPR-Cas Forschung – Beyond Defence

12 Mai 202026 Mai 2020
Vor mehr als zehn Jahren wurde das Immunsystem von Bakterien und Archaeen entdeckt: CRISPR-Cas. Seit seiner Entdeckung wurde das System eingehend untersucht und es wurden viele neue Erkenntnissen gewonnen, wie…
Forschen

CRISPR-Cas Systeme in Haloarchaea: Zusätzliche Funktionen, die nicht zur Verteidigung dienen

7 Mai 202027 Jul 2020
Leitung: Anita Marchfelder Mitarbeiter: Pascal Märkle Standort: Universität Ulm Kurzbeschreibung des Projekts: Vor mehr als zehn Jahren wurde das Immunsystem von Bakterien und Archaeen entdeckt: CRISPR-Cas. Seit seiner Entdeckung wurde…
Grundlagen

Wie entsteht eine wissenschaftliche Publikation?

27 Apr 202027 Apr 2020
In einer Reihe von Beiträgen möchten wir die aktuelle Forschung der Arbeitsgruppen im CRISPR-Konsortium (SPP 2141) näher und einigermaßen verständlich beschreiben. Dazu benutzen wir die offiziellen Projektbeschreibungen der DFG (Deutsche…

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Ältere Beiträge

Willkommen!

Willkommen bei CRISPR-Whisper! Hier berichten Wissenschaftler aus dem DFG-geförderten Schwerpunktprogramm 2141 „Weitaus mehr als nur Verteidigung: die vielen verschiedenen Funktionen des CRISPR-Cas Systems“ über ihre Arbeit. Es geht darum herauszufinden, welche Funktionen die „Gen-Schere“ CRISPR-Cas über die Virenabwehr hinaus noch hat. Fragen und Kommentare sind willkommen!

Aktuelle Beiträge

  • The World of CRISPR with Khalid! – PAM
  • Der Mensch und seine Natur
  • Pauline und die Ausreißer (Teil 6) – Colony PCR
  • Wir sind in den Weihnachtsferien
  • Preisverleihung IGN-Studierendenwettbewerb

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Bildnachweis: Hintze/Universität Ulm
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