Forschen Aktuelle Publikation: Wie arbeiten CRISPR-Cas Proteine eigentlich in der Zelle? 7 Apr 2021 Hier geht es darum, eine Methode für die Forschung zu entwickeln, mit der Proteine innerhalb einer Zelle mit sehr hoher Auflösung betrachtet und bei ihrer Arbeit verfolgt werden können. Mit…
Grundlagen The World of CRISPR with Khalid! – nCas9 und dCas9 30 Mrz 20216 Apr 2021 In einem neuen Stop-Motion-Video aus der Reihe „The World of CRISPR with Khalid!“ widmet sich Khalid diesmal zwei besonders modifizierten Cas9-Proteinen, der Nickase "nCas9" und dem "toten" dCas9, das "d"…
Forschen Online-Meeting des SPP2141 24 Mrz 202124 Mrz 2021 Jährlich treffen sich die Forscherinnen und Forscher des DFG-Schwerpunkprogramms „CRISPR-Cas – beyond defence“ zum wissenschaftlichen Austausch. Pandemiebedingt in diesem Jahr nicht wie geplant in Bonn, sondern per Video-Schalte im Online-Meeting.…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 8) – Des Rätsels Lösung! 10 Mrz 2021 Weiter geht’s mit dem Sequenzieren. Nach dem nun klar war, dass die Zielsequenz auf dem lacZ-Gen nicht mutiert ist, hat sich Pauline der crRNA-Sequenz gewidmet. Zunächst hat sie dafür wieder…
Grundlagen CRISPR-Cas 18 Feb 202112 Mrz 2021 Der Ausdruck „CRISPR-Cas“ beschreibt eine Abwehrstrategie von Bakterien gegen Viren. Das Bakterium „merkt“ sich bestimmte Abfolgen viraler DNA und zerschneidet diese bei einem erneuten Auftreten mit Hilfe eines Cas-Enzyms. „CRISPR“…
Forschen Wir haben nachgefragt 15 Feb 2021 Diesmal bei Marie-Kristin von Wrisberg, frisch gebackene Doktorin der Naturwissenschaften und seit September 2020 zunächst für 2 Jahre wissenschaftliche Mitarbeiterin in der Gruppe von Sabine Schneider, eine der Forscherinnen aus…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 7) – Die Zielsequenz sequenzieren 9 Feb 202110 Feb 2021 Liegt das Geheimnis der CRISPR-Escaper in einer (winzigen) Abweichung ihres genetischen Codes versteckt? Haben die blauen Ausreißer womöglich eine stumme Mutation in der CRISPR-Cas-Zielsequenz auf dem lacZ-Gen, so dass sie…
Forschen Wir haben nachgefragt 1 Feb 202115 Feb 2021 Zahlreiche Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler gehen im Rahmen des DFG-Schwerpunktprogramms (SPP 2141) den vielen verschiedenen Funktionen der Genschere CRISPR-Cas auf den Grund. Einer von ihnen ist Dr. Uri Gophna, Professor an…
Grundlagen The World of CRISPR with Khalid! – PAM 12 Jan 202118 Jan 2021 In seinem jüngsten Stop-Motion-Video aus der Reihe „The World of CRISPR with Khalid!“ erklärt Khalid sehr anschaulich, was es mit den PAM-Sequenzen auf sich hat. Zusätzliche Informationen finden sich in…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 6) – Colony PCR 5 Jan 2021 Vor der Weihnachtspause hat Pauline bereits durch ihr Cracking-Gel festgestellt, dass die blauen Ausreißer tatsächlich beide Plasmide enthalten. Somit sehen sie äußerlich und auch auf dem Agarose-Gel so aus wie…
News Preisverleihung IGN-Studierendenwettbewerb 15 Dez 2020 Vor 12 Jahren hat Science Bridge begonnen, das „Indonesian-German-Network Biology“ (IGN) aufzubauen. Inzwischen beteiligen sich etwa 20 Universitäten aus ganz Indonesien und Wissenschaffende aus verschiedenen Universitäten und Forschungsinstituten in Deutschland…
News Verleihung des Chemie-Nobelpreises 2020 an Emmanuelle Charpentier und Jennifer A. Doudna 10 Dez 202010 Dez 2020 Am 07. Oktober war es endlich soweit - die Trägerinnen des diesjährigen Chemie-Nobelpreises wurden bekannt gegeben. Und es kam so, wie viele es vermutet hatten. Emmanuelle Charpentier und Jennifer Doudna,…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 5) – Ein Blick auf die Plasmide 3 Dez 2020 Kann es sein, dass die blauen Ausreißer das Plasmid „pCas9“ gar nicht haben? Dann wäre das lacZ-Gen intakt. Pauline hat die blauen Zellen auf einer Platte mit Ampicillin und Chloramphenicol…
Grundlagen „The World of CRISPR with Khalid!“ 30 Nov 202011 Jan 2021 Mit Muhammad Khalid Abdullah haben wir einen neuen Künstler für CRISPR-Whisper gewonnen, der in lockerer Folge Stop-Motion-Videos zur Erklärung verschiedener CRISPR-Methoden machen wird.Khalid studiert Biologie im Masterstudiengang an der University…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 4) – Wie hoch ist der Anteil an Ausreißern? 25 Nov 202026 Nov 2020 Die blauen Ausreißer-Kolonien in den geCRISPRten Bakterien sind selten. Vielleicht haben wir einen Fehler gemacht, und es sind uns ein paar wenige blaue Zellen „einfach ins Experiment gefallen“? Wir müssen…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 3) – Die Suche nach blauen Kolonien 17 Nov 2020 Pauline hat sich zunächst die Aufgabe gestellt, mehr von den Ausreißern zu finden. Wie reproduzierbar sind sie, d.h. gibt es sie in jedem Experiment und wenn ja, wie viele davon?…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 2) – Das CRISPR-Experiment kurz erklärt 13 Nov 202013 Nov 2020 Einige Bakterien, wie z. B. das Darmbakterium Escherichia coli, können das Protein Lactase (auch β-Galactosidase genannt) herstellen. Dabei handelt es sich um ein Enzym, das den Milchzucker Lactose (ein „Doppelzucker“…
Laborleben Pauline und die Ausreißer (Teil 1) – Ein kleines Forschungsprojekt zum Mitmachen 3 Nov 202013 Nov 2020 Science Bridge hat ein einfaches Experiment zu CRISPR-Cas entwickelt, die Publikation dazu gibt es unter https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1046202319300039. Ganz kurz zusammengefasst:In einem E. coli-Bakterienstamm liegt das Plasmid pSB20 HIII mit dem lacZ-Gen…
Forschen Evolution von CRISPR-Systemen in prokaryotischen Populationen 12 Okt 2020 Leitung: Franz Baumdicker Mitarbeitende: Klara Burger, offene Stellen zu vergeben (siehe letzter Abschnitt) Standort: Universität Tübingen Kurzbeschreibung des Projekts: Franz Baumdicker beschäftigt sich mit mathematischen Modellen, mit denen die Evolution…
Forschen Diversität verschiedener CRISPR-Cas-Systeme am Beispiel des Cyanobakteriums Synechocystis 29 Sep 2020 Leitung: Wolfgang R. Hess Mitarbeiter: Raphael Bilger Standort: Cyanolab, Albert-Ludwigs-Universität Freiburg Kurzbeschreibung des Projekts: Cyanobakterien gehören zu den ältesten nachweisbaren Lebensformen der Erde. Die Entwicklung der Sauerstoff-freisetzenden Photosynthese in dieser…
Forschen Können tiefe neuronale Netzwerke die CRISPR-Cas „Grammatik“ entschlüsseln? 14 Sep 202014 Sep 2020 Leitung: Alice C. McHardy Mitarbeiter: Philipp C. Münch und René Mreches Standort: Helmholtz-Zentrum für Infektionsforschung GmbH, Braunschweig Kurzbeschreibung des Projekts: Die Arbeitsgruppe “Bioinformatik der Infektionsforschung” um Alice C. McHardy erforscht…
